殿顶筑九脊重檐四面落水的歇山式，正脊是天后殿至高点，两端五彩瓷型双龙戏珠，造型精美，光泽鲜艳，表现整个大脊龙的至高题材，四岔脊头组合凤凰图案，对应大脊成龙凤呈祥，背面作人物故事，配以龙凤、麒麟，玄武、双虎、体现了吉祥如意，庆贺长寿的象征，为闽南建筑艺术之一绝。

　　东西两廊及两轩和寝殿

　　东西两廊及两轩和寝殿，均由国家文物局立案拨出专款依！日复原修缮。东西两廊原置配神二十四司，现改为闽台关系史博物馆陈列室。寝殿又称后殿，地势比正殿高出1米多，两侧突出部位设为翼享，左右斋馆。整座殿字系明代大木构建筑，屋盖为两坡面的悬山楔，面阔七间，35.1米，进深19.8米，高8米许，木质梁架粗大古朴，大木柱置于浮雕仰莲瓣花岗岩的圆形石础之上，殿前檐柱保存一对十六面青石雕的元代印度教寺石柱。估计是明代翻修时称置。柱上接木柱，刻有楹联“神功护海国，水德配乾坤“。正面原有悬挂明代大书法家张瑞图书“后德配天”的横匾，目前正在修建中，属国家木构建筑之瑰宝。

　　闽台关系史博物馆

　　建置于宫内的闽台关系史博物馆是反映祖国大陆（福建）与宝岛台湾历史上渊源关系的专题性博物馆。馆内收藏有大量珍贵的历史文物和民俗文物，近期已举办“闽台民间艺术展”、“泉州古今字书展”、“闽台民俗风情摄影展”等展览。

　　“妈祖”称号的由来

　　“妈祖”是泉州及闽南一带对“天上圣母”的俗称。原来，泉州民间对女性神佛都称“妈”，如“观音妈”、“七娘妈”、“奇仕妈”、“夫人妈”，甚至对于行使神职的巫女，也称为“圣妈”。並且对于这些神和巫，不论其婚否，不论其形像是年高的老太婆或年轻的少女，都一概称为“妈”。况且，妈祖林默娘在世时也行使巫女之事，更是名符其实的“妈”了。至于“祖”字，泉州民间对于至尊神的称呼，则加一个“祖”字。如佛教至尊的释迦如来、三世尊，就概称“佛祖”；道教至尊的玉皇上帝，就称“天公祖”。妈祖形像是一副皇后打扮，大约认为也是至尊的女性神祇，所以就加上一个“祖”字而称为“妈祖”。意思是各种“妈”的至尊。而且从语法构词的性质来说，“佛一祖”、“天公一祖”、“妈一祖”都是一样的构词。此除外了“观音佛祖”而外，就再也没有什么神祇享有“祖”字的称号了。至于仙家的“祖师”，民间则概称“仙公”、“仙祖公”，构词性质也不一样，不能同列而论。实际上，民间所奉的仙很少，更谈不上认哪个仙是至尊，如大名鼎鼎的“太上老君”，民间反而很少奉祀，甚至不了解。

　　泉州民间对于“妈祖”的称号，既实际又谨慎。因为妈祖终其身是姑娘之身，所以民间又称她“妈祖姑”、“妈祖娘”，既亲切又明确。

　　历史沿革

　　宗元时代，泉州成为世界贸易港之一，元政府为了发展海上贸易，于至元十五年（公元1278年），下诏“制封泉州神女护国明著灵惠协正善庆显济天妃。”明永乐五年（公元1405年）出使西洋太监郑和，奏令福建镇守官重新其庙。此后朝廷节遣内宦（太监）及给事中行人（对外使节）等官，出使琉球、爪哇、满刺加等国，率以到庙祭告祈祷为常，永乐十三年（公元1415年），少监张谦出使渤泥（今加里曼丹岛文莱一带），从泉州浯江（顺济桥一带称浯江）启航，“实仗神庥”，归奏于朝鼎新之，改宫号为“天妃宫”。清康熙十九年（公元1680年）施琅征海，师次于此，“神涌潮济师”、“有助顺功”。敕封“护国庇民妙灵昭应宏仁普济天后“，后易宫名为“天后宫”。康熙二十四年，钦差礼部郎中雅虎来宫致祭。雍正元年（1723年）御书匾额“神昭海表”，今悬挂于殿中，乾隆后历代有重修。现在建筑群还保存宋代构件和明清时代木构建筑，是海内外同类建筑中规模较大规格较高、年代较早、而著称于世的古迹，1987年由国家公布为全国重点文物保护单位。